Jaroslav Kubita se narodil v hudebnické rodině v Olomouci. Absolvent pražské AMU a vítěz soutěže Pražského jara v roce 1991 je od roku 2003 sólofagotistou České filharmonie. Jejím členem se stal v roce 1996 po několika letech působení na postu sólofagotisty Symfonického orchestru Českého rozhlasu.
Na fagot hraje od svých deseti let. Již jako dvanáctiletý získal s dechovým triem pod vedením svého otce čestné uznání v mezinárodním kole soutěže Concertino Praga. Jako student uspěl na konci 80. let mimo jiné v soutěžích v Mnichově, Manchesteru a Leszně. Během studií byl ve stejné době sólofagotistou v Mezinárodní filharmonii mládeže pod vedením Jiřího Bělohlávka a v Orchestru mladých Gustava Mahlera vedeném Claudiem Abbadem.
První profesionální zkušenosti získával v orchestru Smetanova divadla v Praze. Jeho učiteli byli Václav Konečný, Jaroslav Řezáč, Jiří Seidl a František Herman.
Zúčastnil se také mistrovských fagotových kursů Ticino musica v Luganu u Jánose Meszárose a Letní akademie salcburského Mozartea, kde vyučoval Klaus Thunemann.
Vedle sólových vystoupení je jeho jméno také spojeno s řadou nahrávek – ve Zlíně na CD natočil fagotové koncerty starých českých mistrů, s Pražským barokním souborem a se Sukovým komorním orchestrem Zelenkovu hudbu, se souborem In modo camerale díla Bohuslava Martinů a francouzskou tvorbu, s Českou dechovou harmonií skladby Mozarta a Kramáře. S těmito soubory koncertuje především v Evropě a Japonsku.
Zasedá v porotách, vede kurzy a masterclassy a od roku 2009 vyučuje hru na fagot na JAMU v Brně.